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プロジェクト概要

爆発はすべてのクエリが蛋白質または DNA かどうかに関係なく使用できるシーケンス データベースを探検するように設計の類似性検索プログラムのセットです。グローバルの線形ではなくローカル シークされ、その結果シーケンスを共有だけ分離された類似の地域間の関係を検出することができるヒューリスティック アルゴリズムを使用します。プライベートなローカル データベースに対する BLAST 検索を実行するために使用することができますと NCBI データベースのコピーをダウンロードまたは完全実行可能ファイルとしてローカルで実行することができます。それは、Mac OS、Win32、LINUX、Solaris、IBM AIX、SGI、Compaq OSF および HP-UX のシステムで実行されます。

システム要件

システム要件が設定されていません
プロジェクトのリリース情報やプロジェクトリソースの情報です。
注: プロジェクトリソースの情報は Freecode.com ページからの引用です。ダウンロードそのものは、OSDNにホスティングされているものではありません。

2010-08-25 07:28 リリース一覧に戻る
2.2.24

このリリースでは、blast_formatterとスタンドアロンのBLAST検索の再フォーマット可能にするためにBLASTのアーカイブ形式を導入しています。これは、BLASTデータベースで翻訳対象のソフトマスキングのサポートを追加します。これは、BLASTトレースバック操作（btop）出力形式のサポートを追加します。これは、利用可能なBLASTデータベースの一覧を表示するblastdbcmdするには、コマンドラインオプションを追加します。リモートBLAST検索の書式設定のパフォーマンスが向上しました。使用メモリ不足の状態からの一貫した終了コードを表示します。複数のスペースで区切られたBLASTデータベースとインデックスmegablastのバグの修正。 Windowsインストーラは、64ビットのインストールに修正されています。
タグ: Enhancements, Bugfixes, Speedups
This release introduces BLAST Archive format to permit reformatting of stand-alone BLAST searches with the blast_formatter. It adds support for translated subject soft masking in the BLAST databases. It adds support for the BLAST Trace-back operations (btop) output format. It adds command line options to blastdbcmd for listing available BLAST databases. Improved performance of formatting of remote BLAST searches. Uses a consistent exit code for out of memory conditions. A fix for a bug in indexed megablast with multiple space-separated BLAST databases. The Windows installer has been fixed for 64-bit installations.

プロジェクトリソース

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