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48 件のプロジェクトが条件に合致します
最終更新日: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

(機械翻訳)
最終更新日: 2021-07-27 22:41

Gabedit

Gabeditは、Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, Mopac2007, Orca, PC Gamess, そして Q-Chemといった計算化学パッケージのためのグラフィカルユーザーインターフェイスです。

最終更新日: 2009-04-14 10:21

DNAStrider

Mac osx 版、もう os9 をサポートしていない Lepard にアップグレードします。このプロジェクトはビルド DNA ストライダー飛竜のヘルプをユーザーが自分のデータを取得し、いくつかの基本的な DNA の実行を分析関数。

(機械翻訳)
データベース環境: SQLite
開発状況: 3 - アルファ
ライセンス: Academic Free License (AFL)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: MacOSX, Linux, Windows XP
プログラミング言語: REALbasic
ユーザインタフェース: Carbon (Mac OS X), KDE, Win32 (MS Windows)
最終更新日: 2009-05-01 07:15

cnsFace

cnsFace は、結晶解析や NMR システムのための GUI です。

(機械翻訳)
開発状況: 2 - プレ アルファ
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Python
トピック: SourceForge.net, 分子科学
ユーザインタフェース: wxWidgets
最終更新日: 2007-02-22 17:33

PyMOL Plugins

PyMOL Pluginsは、PyMOLの多くのプラグインを提供することを目指します。このウェブサイト上でPyMOLについてより詳細な情報を見つけることができます:http://www.pymol.org/

対象ユーザ: 教育, 健康産業, 科学/研究
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C++, Python
ユーザインタフェース: Tk
最終更新日: 2022-02-23 07:11

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

最終更新日: 2009-05-08 11:28

AutoDock Software in Parallel with GPUs

このプロジェクトの CUDA API を使用して NVIDIA の Gpu で並列に実行する !AutoDock ソフトウェアを変更します。ユーザーがダウンロードして、コードをコンパイルし、!AutoDock CUDA 対応グラフィックス カードを使用することができます。Autodock は http://autodock.scripps.edu/に位置して

(機械翻訳)
開発状況: 4 - ベータ
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: POSIX (Linux,BSD,Solaris など), BSD
プログラミング言語: C, C++
ユーザインタフェース: コマンドライン, Console/Terminal
最終更新日: 2017-03-10 18:20

STochastic Engine for Pathway Simulation

シグナリング経路生物細胞の発生のための確率論的シミュレータ。3 D 四面体メッシュの反応拡散プロセスを処理します。

(機械翻訳)
最終更新日: 2016-12-03 05:56

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

最終更新日: 2007-01-23 00:34

glare

GLAREは、化学コンビナトリアルライブラリーデザインのコンテキストで製品の試薬リストベースの最適化のためのソフトウェアとライブラリです。大容量の仮想コンビネーショナルライブラリは、秒単位で最適化されている10 12製品を含有する。

最終更新日: 2018-11-26 20:38

DEEP

1995 年に片輪値段導入微分進化計算ノードごとに 1 つの枝に分かれています、人口と見なされます。差分進化完全並列メソッドは、変更することがなく、個人を生き残ったのイテレーションの数として定義されている個々 の年齢を考慮します。導入された改善は: (I) (k + 1) でいくつかの古い個人許可回支店 kth 支店、(II) 新しい選択ルールから最高のものの同じ番号で上書きすることは、子孫評価でいくつかの目的関数を使用して。この作品は SYSPATHO FP7 プロジェクト №260429 でサポートされています (http://www.syspatho.eu/)、RFBR 助成金 10-01-00627-は、11-01-00573-は、11-04-001162-は、状態と契約をロシア科学省 №14.740.11.0166 №11.519.11.6041

(機械翻訳)
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C
ユーザインタフェース: Console/Terminal
最終更新日: 2018-03-27 00:21

genomecomb

Genomecomb は、完全なゲノム情報の解析用パッケージです。比較、注釈、特に完全なゲノム配列決定の結果をフィルター処理するために使用することができます。

(機械翻訳)
対象ユーザ: 科学/研究
オペレーティングシステム: Linux
プログラミング言語: AWK, C, Tcl
トピック: SourceForge.net, 分子科学
ユーザインタフェース: コマンドライン
最終更新日: 2021-04-12 15:05

ERmod

ERmod (エネルギー表現モジュール) は、エネルギー表示法による溶媒和自由エネルギーを計算するためのプログラム (j. 化学物理 113、6070 (2000))。プログラムは、不均一系を含む、任意の溶剤の溶媒和自由エネルギーを計算することができる、NAMD、GROMACS やオレンジなどの最先端の分子シミュレーション ソフトウェアとの連携で実行することができます。

(機械翻訳)
オペレーティングシステム: POSIX (Linux,BSD,Solaris など)
プログラミング言語: Fortran, Python
ユーザインタフェース: コマンドライン
最終更新日: 2015-03-07 05:42

SketchEl

様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するための化学構造のスケッチツールです。MDL MOLファイルの作成と編集に適しています。

対象ユーザ: 科学/研究
主要対話語: 英語
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: Java
ユーザインタフェース: Java Swing
最終更新日: 2008-07-02 10:01

CAIROTEP

cairoグラフィックスをバックエンドに使用したORTEP-III。

対象ユーザ: 先進的ユーザ, 開発者
オペレーティングシステム: OS非依存
プログラミング言語: C, Fortran
トピック: SourceForge.net, 分子科学