ソフトウェアダウンロードマップ

インディゴは普遍的な有機化学ツールキットです。開発者向けのエンドユーザーとドキュメント化された API のツールが含まれます。それは GGA ソフトウェア サービスが開発したユニークなアルゴリズムとして、ケモインフォマティックスの世界でよく知られているいくつかの標準のアルゴリズムの数が組み込まれていますケモインフォマティックス ライブラリに基づいています。API は、C/Java に藍を統合する開発者ことができます/C ＃/Python プロジェクト。2 つの藍ベースの Java GUI アプリケーションを提供しています： 第 （コンビナトリアルケミストリー） と chemdiff （2 つの自衛隊または笑顔ファイルの視覚的比較）。平野の C で書かれた 3 つの藍ベースのコマンド ライン ユーティリティが用意されて： インディゴ-（分子と反応のレンダリング ユーティリティ） を描く、インディゴ カノ （正規笑顔ジェネレーター) とインディゴ-デコ （R グループ デコンボリューション ユーティリティ）。

GKrellF@H は、Folding@Home クライアントを監視する GKrellM 1.2.x プラグインです。作業単位とワーク ユニットを通じて進行状況のダウンロード時間折り畳まれて分子の名前を表示するように構成できます。開始と停止、Folding@Home クライアントをサポートし、必要に応じて作業単位が完了すると、コマンドが実行されます。

Brabosphere は分子システムとその特性 3 D 可視化のためのプログラムです。その名前は由来量子力学プログラム パッケージ BRABO、それは、グラフィカルなフロント エンドとして機能するため。解析と可視化結果いくつか他の量子力学的アプリケーションからも受け付けておりますので、計算のこのタイプから作成されたデータを使用することもできます。

!PyDespike は despiking のラマン散乱と他の分光データのグラフィカルなクロスプラット フォーム プログラムです。ラマン散乱データのバック グラウンド ノイズのための異常なスパイクを除去するためのファイル、グラフのズーム、および簡単なグラフィカルなメカニズムごとの複数のデータ スキャンをサポートします。

!OpenChrom アジレント ・ テクノロジーからの !ChemStation と同様の方法でのクロマトグラフィー データの質量分析を提供します。などさまざまな液体クロマトグラフィー/質量、GC/MS システム ・ ベンダーからデータ ファイルを処理 (*。アジレント · テクノロジー · フィニガン ITS40 から D) クロマト グラム （*.ms)、NetCDF (*.cdf)、MzXML (*.mzxml)、および他のフォーマット。柔軟性とプラグインによって拡張することができます。

ccwatcher は、彼らは実行として計算化学計算の進行状況を監視します。GUI およびコマンド ライン インターフェイスそれ重要な出力をパースしている SCF エネルギーをプロットしています。Cclib 経由のほとんどの計算化学プログラムをサポートしています。

Modama は処理データおよび分析用 2次元検出器 （画像） 任意の利用可能な探知器、サックスとワックス主にによって提供されるソフトウェア プロジェクトです。

!PhosphoFind を検索し、リン酸化ペプチドを定量化 4 MALDI マススペクトルのセットからの蛋白質でを実行線形正、負、正、リフレクトロン リフレクトロン負とモード線形。

!ProteomeCommons.org Java 分析フレームワークは原子や残渣などの共通の質量分析データを参照するためのフレームワークです。このフレームワークは共通の質量分析データに依存するプログラムを書くを使いやすいライブラリとプログラマを提供します。フレームワークには同位体電卓や残留物の省略のための参照などのユーティリティも含まれています。

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

jsPro は、Javascript クラスはコアを拡張し、新しいクラスの数を提供するライブラリのセットです。目的は Javascript 言語をオブジェクト ベースの機能の豊富なセットを提供します。

XMDS は、方程式を統合コード ジェネレーターです。XML ファイルで人間が読める形式でそれらを書き留めてとそれが治まると書き込みし、アーキテクチャで多分行うことができます高速それらの方程式を統合する C++ プログラムをコンパイルします。

Chemkit 分子モデリング、ケモインフォマティックス、分子可視化用の C++ ライブラリです。