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308 projects in result set
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LastUpdate: 2005-10-22 11:39

Molevolve

Molevolve はアミノ酸からペプチド鎖の構造を 3次元モデルに遺伝的アルゴリズムを実行する Java ライブラリです。クライアント コードは、独自のペプチド鎖モデル、フィットネス関数および GA 操作を指定できます。JDK 1.5 が必要です。

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LastUpdate: 2007-01-28 08:54

PyMOlyze

PyMOlyze 量子化学 (HF/DFT) 計算の結果を分析するグラフィカル プログラムです。様々 な人口分析、フラグメント解析、構造最適化、およびシンプルな中に監視が備わっていますが、強力な XYZ エディター。

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Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Science/Research
Natural Language: English
Operating System: OS Independent
Programming Language: C++, Python
User Interface: Qt
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LastUpdate: 2009-08-27 03:24

Vimes

Vimes: 分子に材料シミュレーション、オープン ソースへのビジュアルインタ フェース python/オープン GL インターフェイスおよび材料シミュレーション プログラム

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LastUpdate: 2011-01-20 23:29

PocketAnalyzerPCA

!PocketAnalyzerPCA タンパク質のポケットを検出する主成分分析とクラスタ リングの幾何学的アルゴリズムを組み合わせたものです。これにより蛋白質の構造の大規模なセットのポケット構造分布の解析と可視化できます。

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LastUpdate: 2014-03-28 10:37

SIMtoEXP

シミュレーション実験のシミュレーション密度情報の直接比較は x 線と中性子から得られる散乱実験、シミュレーション データをフォームの要因に変換することによって可能にするソフトウェアです。また、充填容積モデル スペースに従ってボリューム確率分布を計算します。C++ および Qt で書かれ、SIMtoEXP インタラクティブなプロットを非常にシンプルで使いやすい GUI があります。ソフトウェアは、もともとノルベルト Kucerka によって開発されました。

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LastUpdate: 2014-08-06 16:24

PeptideManager_LRNO

!PeptideManager は、ターゲットを絞ったプロテオミクス手法の設計のためのユニークなペプチド配列の事前選択を支援する目的です。その主な利点はこのペプチッド シーケンスの選択中にホスト/背景プロテオーム (例えば、異種移植サンプル) の存在をようにします。!PeptideManager は様々 な公開リポジトリ !SwissProt/が震えて/!UniProt、!RefSeq (IPI) と様々 なプロテアーゼのペプチッド シーケンス データベースを構築できます。

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Database Environment: SQLite
Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Science/Research
Programming Language: C#
User Interface: .NET/Mono
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LastUpdate: 2011-05-07 00:40

TASE: Illumina Solexa annotation

アノテーションと次世代イルミナ Solexa データセットのタグ棚卸のためのバイオインフォマティクス ツールです。田瀬取り扱い CASAVA 1.0 ビルド、注釈、タグ カウント、および可視化を提供する迅速な方法で。

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LastUpdate: 2005-07-13 04:26

LineageEvolver

!LineageEvolver は分子進化のシミュレーション システムです。シーケンスの進化は、置換、遺伝子重複/死、遺伝子の水平伝達などのモジュール式のプロセスを使用してシミュレートされます。

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LastUpdate: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

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HYBRYD

このプロジェクトは、私は接着剤と呼ばれるして 2005 年に作成されたことは、初期プロジェクトの書き換えです。それをよい Python 2.7.3 と [/projects/freshmeat_gcc/ GCC] 4.6.3 ライブラリする必要がありますを使用して単純な Python 拡張モジュールとして構築しようとしている > python setup.py をインストールし、サーバー、クライアント、または Ipv6 プロトコルを使用して (TCP/UDP) を hybryds (クライアント サーバー) の別の種類を作成することができます。コードのアーキテクチャは、ニューロンのアーキテクチャに基づいています。コードをダウンロードすることができますように利用できるだけ早く (1 つまたはそれ以上私のワイヤレス ネットワーク カード) でアクティブな IPv6 アドレスを置くが。

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LastUpdate: 2006-08-09 20:05

Circadian Modelling

概日時計を構成する遺伝子ネットワークのシミュレーションを実行するためのユーザーフレンドリーなインターフェイスです。モジュールにより、マウスを数回クリックするだけで実験プロトコルのシミュレーション。ユーザーに特別な関心を合わせてシミュレーションを微調整できます。

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LastUpdate: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

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LastUpdate: 2008-08-20 14:43

Protein Geometry Database

タンパク質ジオメトリ データベース蛋白質ジオメトリとしてこのタンパク質モデリング & 洗練されたプログラムのデータにアクセスするためのライブラリを検索するための柔軟なデータベースの開発コードをホストします。

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wavelet_contact_potential_predictor

ウェーブレット変換とaaindex データベースで報告された統計的接触電位のセットによる分解に基づく、タンパク質配列を予測する手法。

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LastUpdate: 2015-06-01 05:16

Open3DGRID

分子間相互作用 (Mif) の高速生成を目的とした、オープン ソース ソフトウェア

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