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LastUpdate: 2012-08-29 23:58

GLmol

GLmol is a 3D molecular viewer based on WebGL and Javascript. You can embed molecular models in Web pages without using Java or plugins.

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LastUpdate: 2003-12-23 11:25

KMovisto

KMovistoはフリーの分子のビューワーで、GAUSSIANのファイルを読み込んで、 高品位な表示をするためのPOV-Rayのスクリプトを出力したり、 Web向けの3次元の分子の画像をつくるためのVRMLファイルを出力します。

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LastUpdate: 2007-07-16 04:01

Biomolecule Toolkit

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

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LastUpdate: 2006-04-27 01:40

SimSoup

!SimSoup は、[/projects/freshmeat_linux/ Linux] と Windows のグラフィカルな人工化学シミュレータです。プログラムは、分子の種類とそれらの間の可能な相互作用の観点から定義する化学を使用できます。シミュレーション実行は、原子炉で各種分子の分子の数を設定し、場所を取る時間の期間にわたって相互作用を許可する必要があります。リアクターで行われているの相互作用がグラフィカルに表示に表示されます。プログラムの開発のための動機は特にに関連して、ネットワークの行動に調査を有効にする ' 代謝最初」理論生命の起源の基本設計を相互作用の任意のネットワークのモデリングをサポートしていますが起こることができるノード間。現在、開発はプロトタイプ段階に達しています。

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LastUpdate: 2006-11-22 02:35

labTimer

labTimer は黒と白のフィルム加工に適してタイマーのセットです。現時点では、プログラムすることができます開発、修正、および洗濯、アラームと素敵なカウント ダウンの基本的なシーケンスに従ってください。

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LastUpdate: 2005-08-23 10:24

Isotopic Pattern Calculator

IPC (同位体パターン電卓) は化学式またはペプチッド シーケンスの同位体比分布を計算する質量分析のためのツールです。Gnuplot を使用して、結果を視覚化します。

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LastUpdate: 2016-09-15 21:25

DWSIM - Open Source Process Simulator

DWSIMはVB.NETで書かれ、先進的な熱力学計算、石油の特性化、完全機能のGUIを介してアクセス可能な仮説コンポーネントユーティリティを備えたオープンソースの化学プロセスシミュレータです。

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LastUpdate: 2016-04-19 23:51

RDKit

ケモインフォマティックスや C++ と Python で書かれた機械学習ソフトウェアのコレクションです。コア アルゴリズムとデータ構造は、C++ で書き込まれます。ラッパーは、Python Java からツールキットを使用してに提供されます。さらに、RDKit 分布には分子リレーショナル データベースに格納されているし、下部組織との類似性検索を介して取得することができます [/projects/sfnet_pgsql/ PostgreSQL] ベースのカートリッジが含まれています。

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LastUpdate: 2006-12-21 09:24

QuteMol

!QuteMol は、インタラクティブな高品質の分子可視化システムです。!QuteMol は革新的な視覚効果の配列を提供する OpenGL シェーダーを通じて現在の Gpu の機能を悪用します。!QuteMol 可視化技術は明快さと三次元形状の理解しやすく、大規模な分子や複雑な蛋白質の構造の改善を目指します。

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LastUpdate: 2007-01-28 22:46

PyMOlyze

PyMOlyze は、量子化学 (DFT) 計算の結果を分析するためのグラフィカル プログラムです。以下の分析は分子のフラグメントをユーザー定義に対応しています: マリケン人口分析 (MPA)、C 乗人口分析 (SCPA)、人口分析の重複、マイヤーの結合の注文。QM パッケージがサポートされますガウス、ADF、GAMESS (米国)、GAMESS (英国) と PCGAMESS。

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LastUpdate: 2006-05-19 09:56

Brabosphere

Brabosphere は分子システムとその特性 3 D 可視化のためのプログラムです。その名前は由来量子力学プログラム パッケージ BRABO、それは、グラフィカルなフロント エンドとして機能するため。解析と可視化結果いくつか他の量子力学的アプリケーションからも受け付けておりますので、計算のこのタイプから作成されたデータを使用することもできます。

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LastUpdate: 2016-03-21 08:06

iterate

反復処理からベ格子探索アルゴリズムの実装である: ・ アンドリュースとバーンスタイン、Acta の水晶。(1988). A44、1009年 1018年格子と 6 空間内の点とベ格子の選択として減らされた細胞突起によって型します。

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LastUpdate: 2005-09-07 10:54

Vigyaan

Vigyaanは、バイオインフォマティクス、計算生物学、計算化学のための電子ワークベンチです。これは、必要なソフトウエアをすべて含んだ、LinuxベースのライブCDで、モデリングソフトウエアが、使用する準備ができた状態でコンピュータを起動させることができる。Artemis、Bioperl、 BLAST (NCBI-tools)、 ClustalX、 Cn3D、EMBOSS tools、Garlic、GROMACS、Ghemical、GNU R、Gnuplot、GIMP、ImageMagick、JMol、MPQC、NJPlot、Open Babel、Octave、PSI3、PyMOL、Rasmol、Raster3D、SMILE、TINKER、XDrawChem、Xmgr、Xfigを含みます。

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LastUpdate: 2004-05-02 17:42

EasyChem

EasyChemは高品質な分子や化学式を描くように設計されています。 (とりわけ有機分子で。)また多くのフォーマットにエクスポートすることができます。 (例えば、PostScript、LaTeX、Fig)

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LastUpdate: 2007-04-08 17:44

PyVib2

!PyVib2 は、ラマン散乱、ラマン光学活性 (ROA)、赤外線振動吸収 (IR)、振動円二色性 (VCD) スペクトルの理解により分子の振動の動きの自動相関を許可します。振動動き、分子にラマン/ROA と IR/VCD 生成の可視化技術とパブリケーション品質スペクトルの生産の汎用性の高い表現 !PyVib2 の機能です。ラマン/ROA との IR/VCD 計算、ダルトンとガウス量子化学パッケージで生成された出力ファイルを直接開くことができます。モルデンと XMol XYZ の形式でファイルをインポートおよびエクスポートすることができます。結果を保存するため、さまざまな形式 (JPEG、TIFF、PNG、PNM、PS、pdf ファイル、GIF、および FLI) はユーザーが利用できます。すべての機能は pyviblib クラス ライブラリを介してアクセスできます。

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