ダウンロードリスト

プロジェクト概要

relaxは、NMR実験データの解析を通じた蛋白質そして他の高分子のダイナミクスの研究のために設計されたプログラムです。R1 と R2 の緩和レートの計算、NOE の計算、スペクトル密度マッピングの削減、Lipari・Szabo モデルフリー分析、N 状態モデル (またはアンサンブル解析) 経由のドメイン運動に関する研究および RDCs PCSsのような異方性NMRパラメータを使用したフレーム順序動力学理論 動的アンサンブルで立体化学の調査、および緩和分散の分析のための指数曲線フィッティングをサポートしています。

システム要件

システム要件が設定されていません
プロジェクトのリリース情報やプロジェクトリソースの情報です。
注: プロジェクトリソースの情報は Freecode.com ページからの引用です。ダウンロードそのものは、OSDNにホスティングされているものではありません。

2013-02-14 07:23
2.2.2

これどこかいくつかのリリースは、それによって緩和データがないが正しく無料モデルの解析で処理されないリラックス最後内導入は重要な問題を解決するマイナーなバグ修正リリースです。その他の小さなバグの数も修正されました。
タグ: Minor bugfixes
This is a minor bugfix release that resolves an important issue, introduced somewhere within the last few relax releases, whereby missing relaxation data is not handled properly in a model-free analysis. A number of other small bugs have also been fixed.

2013-02-02 18:02
2.2.1

このリリースは、Python 3 の問題、PDB 構造を処理するなどの問題と無料モデルの解析に失敗する原因と行方不明の緩和データの数を解決しました。この最新バージョンにアップグレードすることをお勧めします。
タグ: Major bugfixes
This release solved a number of issues, including Python 3 issues, PDB and structure handling, and missing relaxation data causing model-free analyses to fail. Upgrading to this newest version is highly recommended.

2013-01-29 07:37
2.2.0

これは N 状態モデル解析の実装の完了をマーク、主要な機能とバグ修正リリースです。単一の構造体またはアンサンブルに静的構造の N 状態モデルことができます残余のカップリング (RDCs)、pseudo-contact シフト (PCSs) NOEs を介して距離の制約を使用して比較しました。アライメント テンソルに加えて集団または各状態の確率、PCSs を使用する場合常磁性中心の位置だけでなく、最適化できます。
タグ: major feature release, Major bugfixes
This is a major feature and bugfix release that marks the completion of the N-state model analysis implementation. The N-state model allows single structures or ensembles of static structures to be analyzed and compared using residual dipolar couplings (RDCs), pseudo-contact shifts (PCSs), and distance restraints via NOEs. In addition to alignment tensors, the populations or probabilities of each state can be optimized, as well as the position of the paramagnetic center when PCSs are used.

2011-11-15 12:07
1.3.13

これは、リラックス GUI の 2 番目のバージョンであり、主要なコード書き換え。それは今の MS Windows、Mac OS X、Linux の機能。多くのバグ修正に加えて、あるフレーム注文理論 N 状態モデル解析、RDC と PC の値の処理、多数の新しいユーザー機能構造の作成、置換、および重ね合わせと無料のモデルの結果の視覚化ソフトフェアのうちで、dauvergne_protocol の自動解析でリラックス データ パイプ サポート非蛋白質有機分子のために事前のすべての入力データを自動解析の再設計の改善。
タグ: major feature release, gui release, major bug fixes
This is the second version of the relax GUI, and is a major code rewrite. It now functional on GNU/Linux, Mac OS X, and MS Windows. In addition to many bugfixes, there are improvements to the frame order theory, N-state model analysis, handling of RDC and PCS values, a number of new user functions for structure creation, displacement, and superimposition and for model-free result visualisation in PyMOL, and a redesign of the auto-analyses to have all input data pre-loaded into a relax data pipe for support of non-protein organic molecules in the dauvergne_protocol auto-analysis.

2011-08-24 21:13
1.3.12

これはメジャーリリースです。それは、MPIプロトコルを介してコンピュータのクラスタやグリッドでリラックスして実行する機能を追加します。 2007年にすべての方法を開始したゲイリートンプソンのマルチプロセッサ分岐、でこのマージ。 "マルチ"のパッケージには、2つのプロセッサフ​​ァブリック、標準的なユニプロセッサモードとPythonとMPIプロトコルを使用するためのmpi4pyモードが導入されています。モデルフリー解析コードが大幅に近くのスケーリング効率を持つクラスタで計算を高速化、マルチプロセッサモードを活用するために並列化されています。
タグ: major feature release
This is a major feature release. It adds the ability to run relax on clusters or grids of computers via the MPI protocol. This merges in Gary Thompson's multi-processor branch, which was started all the way back in 2007. The "multi" package introduces two processor fabrics, the standard uni-processor mode and the mpi4py mode for using the MPI protocol with Python. The model-free analysis code has been parallelized to take advantage of the multi-processor modes, significantly speeding up calculations on clusters with near perfect scaling efficiency.

プロジェクトリソース