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プロジェクト概要

MCL エッジは、大規模ネットワーク分析の統合、コマンドライン駆動のワークベンチです。直径、クラスター係数、トポロジー、およびネットワークのごまかしの最短経路の計算のためのプログラムが含まれています。読み込みおよびネットワークの定める遺伝子発現データを分析するためのモジュール。MCL アルゴリズムは確率的フローに基づくネットワークの高速かつ拡張性の高いクラスター アルゴリズムです。アルゴリズムによって採用フロー プロセスは数学的に音と本質的にプロセスの跡として明らかにされるクラスター構造に結びついています。スレッドの実装では、時間以内に何百万ものノードのネットワークが処理し、バイオインフォマティクス、グラフ クラスタ リング、およびネットワーク解析の分野で広きます。

システム要件

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2008-06-05 23:05 リリース一覧に戻る
08-157

mclスイートの一般的な目的は、大規模なグラフの解析に広く焦点を向けて、重点を置いて、クラスタリング以外に移動されると、基本的なグラフ上の措置と変換のクラスタリング。プログラムmcxarrayすぐにグラフに入力に表形式の遺伝子発現データを変換することができます。 clmのユーティリティ、およびbetweenness中心のクラスタリング係数は、直径や偏心を計算します。数多くの修正および改善を通じて行われた。
タグ: Major feature enhancements
The mcl suite is moving towards a wider focus on
general purpose large scale graph analysis, with
the emphasis, besides clustering, on basic graph
and clustering measures and transformations. The
program mcxarray can now transform tabular gene
expression data into graph input. The clm utility
computes clustering coefficients, diameter and
eccentricity, and betweenness centrality. Many
fixes and improvements were made throughout.

プロジェクトリソース

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